Подскажите, какие бонусы можно получить за идею?

Предлагаю исправить опечатку в сводке в рекомендациях:

"Создайте цели типа «Клик по кнопке», чтобы отслеживать статистику по всем кликабельныМ элементам на сайте."

Цель - выполнение любой одной из целей. Только не одинаковых, как сейчас, а разного типа.

Смысл очень простой. 

Создаём в интерфейсе метрики/директа/других сервисов календарь. С возможностью добавления в него любых событий, которые по мнению маркетолога/директолога/вебдизайнера/директора/уборщицы могут повлиять на посещаемость или поведение пользователей. Например, "начали раздачу буклетов в супермаркетах", "добавили на сайт раздел Тесты", "поставили на столах ресторанной сети куаркоды с акцией", "изменили цветовую схему сайта", "Мариванна ушла в отпуск", "команде разработчиков увеличили зарплату", "запустили телеграм-канал", "пустили в вотсап вирусный креатив"...

Создаём кнопочку рядом с каждым графиком метрики, где присутствует шкала времени, включить/выключить отображение этих событий.

1. Так мы получаем наглядное представление о том, как повлияли на ту или иную метрику те или иные события.
2. Если добавить возможность расшаривания прав или разделение доступа на создание/изменение событий, то получаем дополнительный инструмент для всей команды, где отмечаются все важные события, которые потенциально могут повлиять на метрику.

Сейчас не совсем удобно ориентироваться в фильтрах, особенно если используется много фильтров по ip. C полем комментарий можно было бы помечать "ip клиента", "ip агенства" и тд

Ограничить в вебинтерфейсе Метрики ползунок "Выбор периода" справа текущей датой (текущим месяцем), а не как сейчас концом года.

В левом меню сделать отдельный раздел для сравнений периодов. Настроить несколько автоматических, например: количество посетителей сайта сегодня и вчера и возможность создания своих отчётов сравнений

Добавить группировку по аккаунту Яндекс.Директ не только в отчете "Директ расходы". Да и в нем можно выбрать только 1 аккаунт.

Данная опция необходима, когда у клиентов несколько аккаунтов, например, по разным товарным направлениям. Иногда надо сравнить общую картину по аккаунтам, а приходится набирать группировку по кампаниям. А кампаний часто бывает очень много в одном аккаунте. Особенно у крупных клиентов. 

Также это поможет быстрее сравнить эффективность работы старых аккаунтов клиента, с новыми, например, при переходе из одного агентства в другое.